أخذت جامعة Fontbonne اسمها من الأم سانت جون فونتبون ، التي أعادت تأسيس مجمع راهبات القديس يوسف (CSJ) في عام 1808 بعد الثورة الفرنسية. قبل أكثر من قرن ونصف ، في عام 1650 ، تم تأسيس راهبات القديس يوسف في ديبوي ، فرنسا. خلال الثورة الفرنسية ، أُجبرت الأخوات على العودة إلى ديارهن وتشتت المجتمع. بعد حوالي 28 عامًا من إعادة التأسيس ، جاءت ست أخوات سانت جوزيف إلى الولايات المتحدة في عام 1836 وأنشأت جذورًا أمريكية في كارونديليت ، وهو مجتمع صغير في جنوب سانت لويس بولاية ميسوري. بعد خمس سنوات ، في عام 1841 ، افتتحوا أكاديمية سانت جوزيف للفتيات.
أنشأت الأخوات في نهاية المطاف كلية لتوفير الوصول إلى التعليم العالي للنساء - وهي حاجة في أوائل القرن العشرين. عقدت الفصول الأولى لكلية Fontbonne College في عام 1923 في كارونديليت في جنوب سانت لويس ، وبعد ذلك بعامين ، انتقلت المدرسة إلى حرم كلايتون الحالي.
ينبع تراث CSJ من القوة والاستقرار من القيم الموجودة في المستندات الأصلية للنظام وتكررت في سجلات أخرى عبر القرون التالية. يمكن تحديد ثماني قيم على الأقل خلال هذا التاريخ الطويل من CSJ: الجودة ، والاحترام ، والتنوع ، والمجتمع ، والعدالة ، والخدمة ، والإيمان ، والوجود الكاثوليكي.
تم تأسيس جامعة Fontbonne على أساس تقليد الخدمة وعلى أساس قيم مجمع القديس يوسف. يستمر التفاني في التقاليد في دفع Fontbonne إلى المستقبل.