استمد النظام التعليمي الحديث طلابه من مدارس القرآن والأزهر عند نشأته ، حيث كانت هناك لجان تجوب البلاد لزيارة مدارس القرآن واختيار الطلاب المميزين للانضمام إلى المدارس الحديثة ، كما تم اختيار طلاب مميزين من الأزهر للانضمام المدارس الثانوية عند إنشائها ، ولكن كان البعض محظوظًا للانضمام إلى البعثة التي أرسلها محمد للدراسة في فرنسا.
هذه المنظمة لم تدم طويلا. في عام 1841 تم وضع الاستيطان المصري العثماني لوضع حدود للمشروع السياسي الذي علق أحلام محمد علي ، والحد من حجم الجيش ، وتقييد سلطة الدولة في إدارة الاقتصاد. لذلك لم تعد الدولة في حاجة لمزيد من الموظفين ، بل قامت بتسريح عدد كبير من الجنود والضباط ، فقرر محمد علي إعادة النظر في النظام التعليمي ، مع مراعاة الظروف الجديدة. ومن هنا نشأ التنظيم الجديد في عام 1841 ، والذي تم بموجبه إلغاء معظم المدارس الابتدائية وتناقص عدد طلاب المدارس الثانوية ، مع مراعاة ما يناسب حاجة الدولة من الخريجين.
يفسر الارتباط بين التعليم الحديث وحاجة الدولة للموظفين حالة التعليم في عهدي عباس حلمي الأول (1848 - 1854) ومحمد سعيد باشا (1854 - 1863).
في عهد الخديوي إسماعيل (1863 - 1879) ، اكتملت مظاهر التبعية بفتح باب الرافعة المالية من المؤسسات المالية الأوروبية على نطاق واسع ؛ يتطلع إسماعيل إلى استكمال البنية التحتية للاقتصاد المصري التي بدأها جده محمد علي من خلال توسيع مشروعات الري وبناء السكك الحديدية والطرق وميناء الإسكندرية ومدن جديدة بقناة السويس (بورسعيد والإسماعيلية) والتوسع العمراني. في القاهرة والإسكندرية. كما تطلع إلى زيادة القوة العسكرية لمصر لتوسيع الوجود المصري في السودان. كل هذا تطلب مبالغ طائلة اقترضها إسماعيل من بيوت مالية أوروبية. ومهما كانت خطة إسماعيل الائتمانية أكملت عملية تكامل الاقتصاد المصري في الاقتصاد الأوروبي لحسم السمة المهنية للإنتاج الزراعي المصري.